Déjame darte una respuesta que sirva para todos los dispositivos. Si estás usando la versión 4.4.2 y quieres actualizarla a la 6.0, teniendo en cuenta que tu dispositivo está rooteado puede que tengas que ver ciertas anomalías.
En primer lugar, el kernel de la 6.0 está un poco actualizado y es diferente al anterior. Así que el uso de los diferentes gestores de recuperación puede estar limitado. Si puedo poner el ejemplo de CM, para ROMs por encima de lollipop, CM ha salido a ofrecer su propio recovery específico para instalar y flashear. Por lo tanto, algunas de las ROMs sólo pueden ser flasheadas si el dispositivo tiene el correspondiente recovery de cm ejecutándose en él. La actualización de su recuperación es la primera cosa que usted debe hacer antes de tomar cualquier otro paso.
Una vez que haya terminado con la instalación, puede flashear la ROM adecuada de su choosing.Having dicho esto, también me gustaría añadir que si usted va para CM, es suficiente para flashear lollipop como CM ha desplegado la actualización OTA de CM 13.1(Android 6.0) por lo tanto, lo que hace que sea fácil para usted para actualizar el software.
P.S: Puede haber circunstancias en las que el núcleo que está utilizando no puede soportar 6.0.Para este tipo de situaciones, recomiendo, que busque en algunos de los foros con los detalles completos del dispositivo, para las personas que ya han hecho la cosa puede ser de gran valor.