En realidad, el propio MathType se convierte en un editor de ecuaciones gratuito si primero descargas la versión de prueba y luego la dejas caducar. Todas las características funcionan durante 30 días, y después de 30 días si no compras una clave de producto, MathType se convertirá en MathType Lite, y se podrá utilizar para siempre. Así que ahí está eso, pero otra ventaja de ese enfoque es que es más fácil para el instructor proporcionar materiales a los estudiantes con la seguridad de que los estudiantes pueden leer, e incluso editar si es necesario, las ecuaciones en su documento. MathType Lite tiene muchas de las características de MathType deshabilitadas, pero con MathType Lite todavía puede editar ecuaciones producidas por la versión completa de MathType - incluso si el autor utilizó características que ahora están deshabilitadas para usted en MathType Lite.
Edición (24 de julio de 2018): Esta respuesta era correcta cuando la escribí hace casi año y medio. Sin embargo, el comportamiento de una prueba de MathType caducada cambiará pronto¹. No habrá más MathType Lite¹. Una prueba de MathType caducada funcionará para permitir sólo 3 cosas, permitir la compra de una licencia de MathType, introducir una clave de licencia ya comprada, o convertir la ecuación actual a una ecuación OMML (es decir, una ecuación del editor de ecuaciones de Word) o a un formato textual. Obviamente, esta conversión OMML sólo se aplica a los documentos de Word. En Pages y otras aplicaciones con las que funciona MathType, podrá abrir MathType, pulsar en "Continuar en modo desactivado" y luego copiar la fórmula como MathML, LaTeX u otros formatos. No podrá editar las ecuaciones ni crear otras nuevas. Siendo todo esto así, MathType Lite dejará de ser una "alternativa gratuita de software MathType para estudiantes", que es lo que se preguntaba.
¹Edición 2 (16 de octubre de 2019): Lo que he descrito en la Edición 1 ya ha ocurrido: ya no hay MathType Lite, y una prueba de MathType caducada solo tiene la funcionalidad limitada descrita anteriormente.