Ah, una pregunta de "mejor" y "Qué es mejor" :). Como siempre "depende" ;).
Si necesitas portabilidad, entonces un portátil es mejor ya que puedes simplemente plegarlo y moverlo. Prueba esto con un ordenador de sobremesa en el día a día y te haces a la idea muy rápidamente (junto con un buen ejercicio).
Si lo que buscas es rendimiento, entonces un ordenador de sobremesa (con el hardware adecuado) no puede ser superado. Un ordenador de sobremesa tiene simplemente un hardware más potente disponible (por un coste menor) y no importa cuánto dinero gastes en un portátil de alto rendimiento, la física está simplemente en tu contra. No puedes simplemente introducir más energía eléctrica en el portátil para realizar todo el trabajo, ya que una parte siempre se convierte en energía térmica, que debe ser transferida de alguna manera. Un portátil no tiene espacio disponible para ello. La GPU de mi ordenador de sobremesa de gama media tiene una capacidad de refrigeración mayor que la que tienen los portátiles Gaming para su GPU y CPU combinadas.
Si lo que buscas es la eficiencia energética, lo tendrás difícil para superar a un portátil de oficina normal, ya que esencialmente alimentas todo el ordenador de media con menos electricidad que un monitor de sobremesa común.
Si usted está buscando en la ergonomía incorporada, entonces su escritorio tiene una clara ventaja sólo por tener una pantalla más grande (más bienes raíces para hacer el trabajo), en general, un teclado mucho mejor para escribir y un touchpad no se acerca a la precisión sobre un ratón de escritorio. Todas estas partes pueden estar bien dispuestas para tu comodidad, mientras que en un portátil estás bastante apretado en comparación (seguro que puedes comprar periféricos externos con un monitor grande, pero ahí va tu ventaja de portabilidad por la ventana ;)).
Para resumir, "lo que es mejor" depende de para qué lo necesitas. En la vida no suele haber "lo mejor en general" sino lo que es "mejor para una tarea concreta". Los martillos se consideran "lo mejor" si quieres clavar un clavo pero son bastante horribles cuando se trata de atornillar un tornillo.