Depende del estado en que se encuentre el viejo ordenador, especialmente si data de la época de la plaga de condensadores. Las tarjetas de vídeo AGP serán muy difíciles de conseguir, al igual que las unidades PATA y SCSI. Si el ordenador sólo tiene ranuras ISA o MCA (lo que, para ser justos, puede significar que es tan antiguo que Win98 sería inutilizable), estarás limitado a Ethernet 10BaseT, si es que puedes encontrar algo, y tendrás que improvisar algo con un AP externo o un mini-router para el Wifi. Y si el chipset de su placa base resulta ser un i820, puede venderlo a la fábrica de pegamento, porque no querrá intentar resucitar uno de esos montones de mierda con errores.
El problema de la plaga de condensadores es un problema bastante importante para los sistemas de la era Win9x. Si su placa base sufre de condensadores reventados y resulta que es un sistema ATX, también puede destripar todo el sistema hasta el chasis y construir un nuevo ordenador desde el interior. (Todavía se pueden conseguir adaptadores de USB a PATA con bastante facilidad, así que puedes conservar el viejo disco duro mientras siga funcionando, aunque probablemente necesitarás una nueva unidad de arranque y un sistema operativo moderno. No estoy seguro de que puedas utilizarlo como unidad de arranque para una máquina virtual, pero vale la pena intentarlo). Es posible que necesites un par de herramientas, como una Dremel, en caso de que la nueva placa base necesite agujeros que la vieja carcasa no tiene. Por otro lado, si no es una ATX, deséchala; no merece la pena el esfuerzo (es decir, una reestructuración interna masiva de la caja, al mismo nivel o peor que construir un Macquarium). Por último, si vas a poner un mobo nuevo, probablemente tendrás que cambiar la fuente de alimentación de todos modos, pero eso es especialmente importante con algunos sistemas Dell de alrededor del año 2000; utilizaban una fuente de alimentación no estándar con placas base especiales de Intel, en su mayoría ATX, y puedes estropear el mobo, la fuente de alimentación o ambos si intentas utilizar una placa ATX estándar. No te arriesgues; mobo nuevo, PS nuevo, sin excepciones.
La única cosa que me preocuparía es un punto sobre el hardware antiguo en general - los ordenadores de sobremesa son glotones de energía. Los sistemas SFF modernos como el Intel NUC y el Mac Mini utilizan la misma energía, o no mucha más, que los típicos sistemas portátiles. (Por ejemplo: Mi Mac Mini tiene una potencia de 85W; mi MacBook Pro, apenas 60W. La mayoría de los modelos NUC utilizan incluso menos que eso, incluso cuando funcionan a pleno rendimiento). Los SBCs ARM como la Raspberry Pi 2 y la BeagleBone Black utilizan mucho, mucho menos que eso, y es posible que puedas ejecutar Win98 en emulación en una RPi 2. (No se garantiza que los resultados sean impresionantes. O incluso adecuados.) Si puedes reducir tu consumo de energía en un 80% haciendo lo que quieres en un nuevo sistema, ¿por qué molestarse en tratar de resucitar el viejo?