Cuando acabas de conseguir una nueva aplicación Android y la inicias, se optimizará. También cuando instalas una nueva ROM, la primera vez que arranca, Dalvik pasará por todas las apps que tengas instaladas y extraerá el archivo Dex, lo optimizará y lo guardará como Odex en la caché. Es muy necesario limpiar la caché de Dalvik cuando se instala una nueva ROM. Si no lo haces, Dalvik se saltará la optimización de las aplicaciones que tengas instaladas porque encontrará los archivos Odex en caché y no necesitará volver a crearlos. Como resultado las aplicaciones no estarán optimizadas para la ROM actual de Android y probablemente tendrás problemas de "Force close".
Por eso Wiping Dalvik Cache es necesario cuando se instala una nueva ROM, además lo puedes hacer las veces que quieras, no hace nada malo, sólo borrará los archivos de caché Odex y cuando estés iniciando una app o reiniciando el dispositivo el Odex se recreará automáticamente.
Así que técnicamente no borra tus datos y en cambio optimiza tu app bu esto es temporal.