¿Estás usando iPhone o Android?
Es importante porque los pasos son diferentes para ellos.
Me adelanto a decir que si estás usando un iPhone, no puedo ayudarte. No poseo ni manejo ningún dispositivo de la manzana, tengo una mínima experiencia con ellos a través del trabajo, los amigos y la escuela, pero la mayor parte de eso es el uso de una sola operación que no requirió que pasara ninguna cantidad de tiempo jugueteando en el sistema. Sé lo suficiente para saber que los siguientes métodos no funcionarán en iOS.
Los archivos ocultos son fáciles. Descarga una aplicación de gestión de archivos, yo uso EStrongs File Explorer Pro pero no tiene que ser la versión pro, y en los ajustes, hay una opción para "mostrar archivos ocultos." Los archivos ocultos se mostrarán ligeramente atenuados. Eso sí, ten cuidado ahí, si borras algo importante puedes acabar con un pisapapeles muy caro si no sabes cómo recuperar tu teléfono.
También puedes explorar tu teléfono mientras estás conectado a tu PC, pero no es 100% efectivo. Los sistemas operativos basados en Linux, como Android, tienen una forma de ocultar los archivos diferente a como lo hace Windows. Por ejemplo, hay una carpeta oculta en la tarjeta SD de mi teléfono a la que llamé ".work", ese punto (.) antes de la palabra hace que Android lo lea como un archivo oculto, y cuando me conecto a mi ordenador no puedo ver esa carpeta. Sin embargo, cuando me conecto a mi teléfono en Linux Mint, puedo verla.
Así como mover una carpeta que está marcada como "oculta" en Windows no estará realmente oculta en tu teléfono, pero una carpeta o archivo oculto en Linux se movería como una carpeta o archivo oculto en Android.
Para las aplicaciones ocultas, es un poco más complicado. Todavía puedes descargar aplicaciones de terceros que te mostrarán todas las apps instaladas, aunque no aparezcan en tu launcher, pero muchas veces para eliminar estas apps es necesario rootear el teléfono. (para esto prefiero Titanium Backup pro, pero puedes elegir algo más aquí también.)
Muchas de las aplicaciones que encuentro ocultas suelen ser las aplicaciones incluidas que fueron instaladas por el fabricante y el operador antes de que yo comprara el teléfono. cuando vas a "desinstalar" estas aplicaciones normalmente no se desinstalan realmente sino que se convierten en "desactivadas". Esto significa que ahora ya no se muestran en tu lanzador de aplicaciones, y no puedes usarlas a menos que descargues todas sus actualizaciones de nuevo, pero los archivos originales de base siguen ahí ocupando espacio en tu teléfono.
Debido a que estas aplicaciones son software empaquetado, se instalan en un directorio protegido diferente en tu teléfono y normalmente no pueden ser eliminadas, pero si haces root a tu teléfono pueden serlo. No recomiendo este curso de acción para alguien que no tenga experiencia en el campo, porque de nuevo puedes terminar con un pisapapeles muy caro, incluso si sabes lo que estás haciendo.
No vale la pena el riesgo de Rooting sólo para eliminar las 3 o 4 aplicaciones que no usas, la mayoría de las personas que lo hacen tienen razones muy específicas para hacerlo. Si no sabes por qué quieres rootear tu teléfono, lo más probable es que no quieras hacerlo. Es una gran molestia y probablemente no es algo que quieras mantener. Sólo estarías desbloqueando un montón de características que nunca usarías. Es como si un piloto de Nascar se comprara un McLaren F1. Se ve genial, pero no va a conducir eso en las pistas.
No quiero decir que los pilotos de Nascar no deban comprar el coche que quieran, pero si lo fueran a comprar para competir, no es lo que buscan.