Varias formas, normalmente Alt+F4 cierra el programa actual, pero si no hay ningún programa actual cierra todo el SO (realizando un apagado).
Algunos SO tienen atajos de teclado para tareas específicas. Por ejemplo, Windows utiliza Ctrl+Esc (o en algunos teclados especiales hay una tecla Win) que abre el menú de "inicio" - a continuación, puede utilizar las teclas de flecha para mover la selección a la opción de apagado y pulsar enter.
Algunos utilizarían cosas como Ctrl+Alt+Del para abrir un menú del sistema que tiende a incluir una opción de apagado también. Esto es definitivamente el caso de Windows, aunque algunos Linuxes también lo tienen. De esta forma puedes apagar aunque haya otros programas abiertos en ese momento.
También hay formas de apagar desde una línea de comandos. Ver otras respuestas para el método de Windows. En Linux el comando también es shutdown, sólo que con varias otras opciones disponibles: Ayuda y ejemplos del comando shutdown de Linux
Observe que le pueden preguntar sobre programas que tienen cambios sin guardar. Normalmente puede usar las teclas de flecha y enter para cerrar / guardar estos, pero puede haber algún programa que necesite un clic del ratón.