Así que antes de empezar, voy a definir rápidamente lo que es un troyano, le dará una mejor comprensión de lo que está tratando. El troyano es una aplicación maliciosa disfrazada de software semi-útil. Diseñado para infiltrarse en su PC de esta manera. Puede ser cualquier forma de malware, así que sí, puede ser bastante difícil de eliminar a veces.
Ahora, el antivirus es lo que le protege de una amplia gama de virus y otras formas similares de infecciones de PC. El antimalware te protege de malware como troyanos, adware, hijackers y demás. La versión gratuita de Malwarebytes y Hitman Pro son exclusivamente software antimalware, no antivirus. Su planteamiento de la situación fue correcto, simplemente ajustando sus definiciones de software malicioso.
Más o menos deberían haber limpiado el troyano, pero en caso de que te preocupe, puedes hacer un escaneo completo del sistema para confirmar que se limpió todo, los pasos para ello son los siguientes:
1. Reinicie el PC en "modo seguro con red"
2. Instale cualquier antivirus popular y haga un análisis rápido (la mayoría de los proveedores tienen versiones gratuitas de su software). O simplemente utilice Windows Defender. Funciona muy bien en la mayoría de los casos.
3. Escanea tu PC con Malwarebytes y Hitman Pro.
4. Reinicia el PC en modo normal y haz otro escaneo rápido con Malwarebytes.
Estos pasos deberían eliminar por completo cualquier software malicioso. Si tienes alguna pregunta adicional sobre el tema, no dudes en comentar, estaré encantado de responderla.