No creo que debas aprender las "reglas" al principio.
En mi opinión, la mejor manera de aprender animación es HACERla. Creo que es una buena manera de saber cuáles son las reglas que quieres conocer.
Yo logré mi primer corto animado que es sólo 40s cuando tenía 13 años y yo incluso didn't saber lo que's el significado de stoyboard. Pero me divertí mucho sobre cómo crear cosas.
Si sólo quieres aprender cómo funciona la industria de la animación o ser un animador. Recomiendo encarecidamente el libro, The Animator's Survival Kit de Richard Williams, y seguirlo paso a paso( aprender a dibujar al principio).El primer capítulo es el más importante.
Flash puede ser una buena opción. Tiene una poderosa herramienta de línea de tiempo y es muy fácil de aprender (omite las partes de Action Scripts). ToonBoom o Anime Studio es demasiado complicado para el principiante, también todas las herramientas 3D. Recuerde, no convierta el problema en "Cómo aprendo el software de animación".
I'm still learning how to write in English, so sorry for my English mistakes:)