Depende de la caja, de los componentes y del tamaño de los ventiladores.
En general, un sistema de gama baja tendrá un ventilador para la CPU, un ventilador de entrada y un ventilador de salida, ¡pero en realidad es posible no tener ninguno! Hay "sistemas pasivos" que utilizan dispositivos Peltier para la CPU (y la GPU, si es necesario) y utilizan la "refrigeración por convección", que utiliza disipadores masivos y grandes áreas perforadas en el exterior de la caja, para el resto del sistema.
El "número necesario de ventiladores" depende de la cantidad de calor que genere su sistema y de cuál sea la temperatura ambiente del entorno del ordenador. La mejor opción es equipar la caja con lo que creas que sería el mínimo que necesitarías, y luego monitorear las temperaturas del sistema (con una utilidad de software como HWinfo) bajo una carga de trabajo pesada - (tendrás que buscar el rango de temperatura recomendado de tu placa base, CPU, GPU y unidades) - y, si una temperatura comienza a subir más allá del rango recomendado para cualquier componente dado, apaga inmediatamente y añade un ventilador para enfriar el área afectada.
Una advertencia: para evitar que el polvo se acumule en el interior del ordenador, lo mejor es mantener una presión de aire positiva - es decir, el flujo de aire total de los ventiladores que soplan hacia el interior de la caja debe superar ligeramente el flujo de aire de los que soplan hacia el exterior. Convierte el flujo de aire de todos los ventiladores a la misma unidad -digamos CFM (pies cúbicos por minuto)- y luego suma las cifras de todos los ventiladores que soplan hacia el interior (sin tener en cuenta los ventiladores internos como los de la CPU y la GPU). A esta cifra hay que restarle todas las cifras de los ventiladores que salen. La respuesta debe ser siempre un número positivo (pero no mucho mayor que 50 cfm).