Algo está escribiendo basura en una de las siguientes ubicaciones:
Directorios%TEMP% (C:/windows/system32/Temp
Directorio temporal local (C:/Users//AppData/Local/Temp)
Directorio de datos de aplicación (C:/Users//AppData...)
Carpeta "Mis Documentos". (La creación de muchos guardados para algunos juegos puede suponer gigabytes de espacio).
Aplicaciones como Chrome y Picasa pueden escribir fácilmente gigabytes de datos en una de las carpetas AppData. Algunas de las páginas web que utilizan el almacenamiento de datos HTML5 (o como se llame) también pueden acumular mucha basura. Una de estas aplicaciones es la página web de "Mega".
Durante el procedimiento de actualización de windows, windows update almacena frecuentemente los paquetes descargados dentro de la carpeta package cache.... Y además los puntos de restauración del sistema se comen el espacio disponible.
Además, el archivo de páginas también puede ocupar bastante espacio en el disco, y si empieza a crecer, el espacio se irá reduciendo poco a poco.
Una forma decente de averiguar qué se ha comido el espacio de tu disco duro es usar una aplicación como space sniffer. Esta es gratuita y te da una buena visión gráfica del espacio utilizado. Otra aplicación decente es WinDirStat y hay varias otras aplicaciones de este tipo disponibles.