Sí, sólo tienes que usar diskpart para limpiar la unidad y borrará todas las particiones de tu disco. También puedes eliminar sólo la partición de Windows.
Arranca desde un instalador de Windows en USB/DVD.
Cuando estés en la pantalla de configuración mantén pulsada la tecla shift y pulsa F10 y se abrirá un símbolo del sistema. Escribe diskpart y pulsa enter.
La pantalla se detendrá un rato mientras se carga diskpart, finalmente te saldrá una línea de comandos diskpart.
Escribe list disk y pulsa enter, saldrá una lista de tus discos duros en tu ordenador por tamaño. Identifica cuál es el que tiene la partición que quieres borrar.
Escribe select disk 0 y dale a enter donde pones el número del disco al que quieres acceder en lugar del 0.
Escribe list partition y dale a enter, te mostrará una lista de particiones. Identifica el número de la que quieres borrar (la de Windows).
En este punto si quieres borrar todas las particiones simplemente escribe clean y dale a enter y tu disco se borrará. De lo contrario, si sólo quieres borrar la de Windows escribe seleccionar partición 0 y pulsa intro. Donde 0 es el número de la partición que desea borrar.
Escriba delete partition y pulse enter. Tu partición de Windows se borrará ahora.