Fotos te pregunta si quieres migrar tu biblioteca de iPhoto actual cuando la inicias por primera vez en tu Mac. Digo actual porque tengo tres bibliotecas de iPhoto. La que migré y dos que no lo hice. Utilizo iPhoto Library Manager para cambiar entre las bibliotecas activas. Cambié a la biblioteca que está en iCloud, lancé Fotos y migró todo sin problemas. No tocó mis otros dos archivos de la biblioteca.
Fotos está buscando "iPhoto Library" en el lugar que especificó en las Preferencias de iPhoto. iPhoto Library Manager (iPLM) le permite nombrar sus otras bibliotecas a lo que quiera. Cuando eliges una biblioteca, iPLM la renombra como "iPhoto Library" en segundo plano. Lanzas iPhoto desde iPLM y entonces puedes usarlo para gestionar tu fototeca.
Te cuento todo esto porque Apple no suele estropear una migración de una de sus propias apps a otra de sus propias apps. Puede pasar cualquier cosa pero según mi experiencia anecdótica, tu padre está bien. Además, debería hacer la migración mientras esté en la versión de macOS en la que todavía funciona iPhoto. Si se estropea, todavía tiene acceso a su biblioteca o puede hacer una migración manual, que es arrastrar y soltar galerías individuales de iPhoto a Photos.