Hacer esto por sí mismo no es 'perjudicial' para sus ojos. Dicho esto, la razón por la que trabajar en la oscuridad causa problemas es porque una fuente de luz parpadeante hace que las pupilas tengan que contraerse y dilatarse muchas veces rápidamente, una y otra vez. Hay músculos implicados en este proceso y, como cualquier otro músculo, su uso excesivo puede ser sintomático: fatiga visual, dolores de cabeza, etc. Esto también dependerá en parte del tipo de monitor que tengas, la tasa de refresco, la resolución, etc.
Así que, incluso con alguna iluminación ambiental baja en la habitación cercana, como una lámpara, el uso del ordenador puede ser menos problemático.
El uso del ordenador por sí solo, ya sea con luz adecuada o no, también se asocia con el síndrome del ojo seco debido a la disminución de la tasa de parpadeo -también se ve con cosas como conducir, leer un libro o ver la televisión- y también el parpadeo incompleto -más común en el uso de dispositivos digitales más que un libro-. Estamos viendo más síndrome del ojo seco en personas más jóvenes y esto es probablemente un factor que contribuye.