Los androides llevan los ojos vendados porque
1) son el HUD táctico que utilizan para ver la información y los mapas del enemigo. (Los operadores tienen micrófonos que parecen velos sobre la boca de forma similar). Veo esto como una especie de razón in-universo para ello, pero sigue siendo una razón.
2) Simbolismo.
3) Estética
Si te fijas en los operadores, llevan velos sobre la boca mientras hablan con sus androides en el campo. El único miembro de YoRHa que no lleva ni venda ni velo en la boca es la Comandante.
Así que los operadores deben mentir (sin saberlo) a los androides. ("no hablar mal")
Los soldados deben estar ciegos a la verdad. ("no veas el mal")
y sólo la comandante conoce la verdad sobre aquello por lo que luchan, por lo que su rostro está descubierto.
Cuando a 2B y 9S les quitan o arrancan la venda de los ojos, suele ser durante revelaciones significativas o escenas que les impactan emocionalmente. No es una coincidencia que las pocas veces que se le quita la venda a 2B es cuando está más emocionada - esta es la verdadera 2B, no la "máscara" o personaje que se pone para los demás. Lo mismo ocurre con 9S. (¿Recuerdas cómo se quitó la venda lentamente cuando se enfrentó a los modelos de 2B en la torre?) Es una forma visual de que los desarrolladores señalen cuándo los androides están siendo su yo "auténtico" para el público en lugar de lo que se supone que son.
Además, queda muy bien y llama la atención de inmediato al mirar a los personajes.