Los sistemas operativos y la mayoría de las aplicaciones no se instalan en medios extraíbles. Aunque la unidad "externa" es una unidad SATA estándar en una caja USB, todavía es visto por el BIOS/UEFI como "medio extraíble" para fines de instalación.
Sin embargo: probablemente puede instalar un sistema y aplicaciones a la unidad si se conecta primero a través de SATA y luego transferirlo a una caja USB.
Sin embargo: es probable que tenga problemas con los mapeos de letras de unidad; que puede ser trabajado con un poco de técnica de mano (por ejemplo, los comandos SUBST y ASSIGN) pero puede ser poco fiable y estar sujeto a rarezas aleatorias.
Otro problema es que va a ser S L O W a menos que su carcasa de la unidad y la placa del sistema soporten USB 3.x o eSATA.
Y olvídese de tomar la unidad externa y tratar de ejecutar sus cosas en un sistema diferente, a menos que sea la misma placa base y controlador de pantalla. Lo peor que puede pasar no es que no arranque, sino que arrancará y Windows instalará un conjunto totalmente diferente de controladores, fastidiando su configuración ya lenta.